«اسلام به مبارزه می‌طلبد» به مواجههٔ اندیشهٔ اسلامی با تفسیرهای مادی از دین و جهان می‌پردازد. نقطهٔ آغاز بحث، این پرسش است که دفاع از دین در عصر علوم جدید چگونه باید صورت گیرد و چه تفاوتی میان شناخت روش پژوهش جدید و پذیرفتن بی‌چون‌وچرای نتایج آن وجود دارد. مقدمه بر ضرورت فهم دقیق دیدگاه مخالفان تأکید می‌کند و تطبیق شتاب‌زدهٔ آموزه‌های اسلامی با نظریه‌های رایج را به نقد می‌کشد. در توضیح این مسئله، نمونه‌هایی از تفسیر تکاملی زندگی، توجیه دوزخ به عنوان جای تربیت و موقتی دانستن مالکیت فردی مطرح می‌شود. این مثال‌ها نشان می‌دهند که پذیرش یک تصور فراگیر می‌تواند برداشت از مجموعه‌ای از باورها و احکام را تغییر دهد. همچنین دربارهٔ تفاوت پژوهش بی‌طرفانه و شیوهٔ تنظیم نتایج تحقیق، و استفاده از گفته‌های دانشمندانی با باورهای متفاوت بحث می‌شود. ساختار کتاب در نه بخش پیش می‌رود. نخست، نظریه‌های مخالفان دین از زاویهٔ علوم طبیعی، روانشناسی و تاریخ معرفی و نقد می‌شوند. سپس روش استدلال علمی و دشواری شناخت حقیقت پدیده‌ها مطرح می‌گردد. مباحث بعدی به نظم جهان، وجود خدا، دلایل آخرت، مسئولیت انسان، ضرورت نبوت و قرآن اختصاص دارند. فهرست، بررسی ارتباط قرآن با یافته‌های نوین، اخترشناسی و زمین‌شناسی را نیز نشان می‌دهد. در ادامه، مشکلات قانونگذاری، پیوند قانون و اخلاق، اجرای عدالت، روابط زنان و مردان و ساختار اقتصادی مطرح می‌شوند و بخش پایانی به حیات طیبه می‌رسد.